Ovim zakonom se nastavlja proces reformi u sektoru voda, u skladu sa pravom Evropske unije. Nakon stupanja na snagu važećeg zakona o vodama, stupili su na snagu mnogi zakoni koji delimično uređuju i vodoprivrednu oblast, te se javila potreba za usaglašavanjem zakona o vodama sa tim zakonima.

Zakon o javnoj svojini propisuje da su vodno zemljište i vodni objekti dobra od opšteg interesa i da se način i uslovi iskorišćavanja regulišu posebnim zakonom, dakle zakonom o vodama, koji ne sadrži odgovarajuće odredbe.

Zakon iz oblasti planiranja i izgradnje odredio je da je za dobijanje građevinske dozvole potrebno priložiti eventualno i dokaz o postojanju prava službenosti. Postojećim Zakonom o vodama nije regulisano izdavanje službenosti na vodnom dobru.

Takođe, novim zakonom se pokušavaju otkloniti nedostaci koji su se javili u primeni postojećeg zakona u vidu nejasnih odredbi vezano za raspolaganje vodnim zemljištem, nejasnih odrebi o vodnim objektima za navodnjavanje, odvodnjavanje, vodnim područjima, godišnjem programu upravljanja vodama, sadržini operativnih planova za odbranu od poplava, erozionim područjima, vađenju rečnih nanosa, pravnim licima nadležnim za vršenje ispitivanja kvaliteta otpadnih, površinskih i podzemnih voda, izdavanju i oduzimanju licenci, vodnim aktima i organima nadležnim za izdavanje vodnih akta, finansiranju poslova od opšteg interesa u oblasti upravljanja vodama i organima nadležnim za inspekcijski nadzor i kaznama.

Reguliše se ko vrši ispitivanje kvaliteta površinskih i podzemnih voda. Radi zaštite životne sredine vrši se dopuna odredbi koje uređuju sadržinu Plana zaštite voda od zagađivanja i propisuje obaveza određivanja osetljivog područja i nadležan organ.

Usled usklađivanja sa propisima Evropske unije uvode se definicije pojmova aglomeracija, biota, mulj, seoski vodovod, magistralni cevovod, poplave, ledene poplave, standardi kvaliteta životne sredine i hidromeloracioni sistem, voda za kupanje i voda za piće.

Prenošenjem nadležnosti za izdavanje vodnih akata javnim vodoprivrednim preduzećima, dolazi do skraćivanja vremena trajanja ovog postupka, jer je do sada javno vodoprivredno preduzeće izdavalo mišljenje za izdavanje vodnog akta, a sam vodni akt je izdavalo ministarstvo.